Keskiaasiankoiran luonne on tasapainoinen, ylpeä ja itsenäinen. Koiralle on ominaista itsevarmuus ja jopa jonkinasteinen salaperäisyys. Ulkopuolisia kohtaan eläin käyttäytyy epäluuloisesti ja varovaisesti, mutta osoittaa samalla hämmästyttävää herkkyyttä omistajan mielialalle.

Keskiaasiankoira on taipuvainen nopeaan sosiaaliseen sopeutumiseen, ja se löytää helposti paikkansa ihmisperheessä. Sen suhtautumista muihin "lauman" jäseniin voidaan luonnehtia rauhanomaiseksi. Ne suhtautuvat rauhallisesti myös lemmikkieläimiin, jotka asuvat niiden kanssa saman katon alla. Keskiaasiankoirat suhtautuvat lapsiin erittäin hyvin.

Aito keskiaasiankoira osoittaa epäluottamusta vierasta kohtaan hillitysti - se antaa vartiointivaistoilleen vapaat kädet vain, jos vieras selvästi provosoi. Keskiaasiankoiran aktiivisella puolustusreaktiolla on omat erityispiirteensä. Se vartioi aluettaan hyvin mustasukkaisesti ja osoittaa aggressiivisuutta vain siinä tapauksessa, jos sen asettamaa rajaa rikotaan. "Neutraalilla kaistalla" koira reagoi muihin eläimiin tai tuntemattomiin ylimielisellä välinpitämättömyydellä.